Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl35Q9CZ49 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms