Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nsfl1cQ9CZ44 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nsfl1cQ9CZ44 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms