Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Snf8Q9CZ28 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snf8Q9CZ28 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms