Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prelid3bQ9CYY7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prelid3bQ9CYY7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms