Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hcfc1r1Q9CYQ5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms