Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rrs1Q9CYH6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrs1Q9CYH6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms