Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ssu72Q9CY97 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ssu72Q9CY97 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms