Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bud23Q9CY21 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Bud23Q9CY21 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms