Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem175Q9CXY1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem175Q9CXY1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms