Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem50aQ9CXL1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tmem50aQ9CXL1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem50aQ9CXL1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms