Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Sgo1Q9CXH7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sgo1Q9CXH7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sgo1Q9CXH7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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