Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms