Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rbm8aQ9CWZ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rbm8aQ9CWZ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rbm8aQ9CWZ3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms