Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ndufaf1Q9CWX2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms