Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4930535I16RikQ9CUI2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms