Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930553M12RikQ9CUH1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930553M12RikQ9CUH1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930553M12RikQ9CUH1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms