Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otud1Q9CUB6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otud1Q9CUB6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms