Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rhobtb3Q9CTN4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhobtb3Q9CTN4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhobtb3Q9CTN4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhobtb3Q9CTN4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms