Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rprd1bQ9CSU0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms