Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NmbQ9CR53 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms