Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Klhl28Q9CR40 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Klhl28Q9CR40 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms