Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Smim8Q9CQQ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smim8Q9CQQ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smim8Q9CQQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Smim8Q9CQQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Smim8Q9CQQ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smim8Q9CQQ0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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