Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pkp2Q9CQ73 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms