Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms