Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930519G04RikQ9CPT7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
4930519G04RikQ9CPT7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms