Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Bhlhe41Q99PV5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms