Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim26Q99PN3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms