Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtn4rQ99PI8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtn4rQ99PI8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms