Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc4Q99PH1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc4Q99PH1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms