Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GpnmbQ99P91 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GpnmbQ99P91 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GpnmbQ99P91 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms