Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab27bQ99P58 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab27bQ99P58 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms