Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cep41Q99NF3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms