Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NsmfQ99NF2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NsmfQ99NF2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NsmfQ99NF2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms