Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Bco2Q99NF1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Bco2Q99NF1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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