Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Mrpl1Q99N96 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl1Q99N96 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms