Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brms1Q99N20 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Brms1Q99N20 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Brms1Q99N20 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms