Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a6dQ99N07 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a6dQ99N07 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms