Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4dQ99N05 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ms4a4dQ99N05 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ms4a4dQ99N05 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Ms4a4dQ99N05 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ms4a4dQ99N05 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Ms4a4dQ99N05 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ms4a4dQ99N05 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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