Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrrtQ99MR6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrrtQ99MR6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms