Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR3

Slc12a9, Solute carrier family 12 member 9, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a9Q99MR3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc12a9Q99MR3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc12a9Q99MR3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms