Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1b4Q99ME6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1b4Q99ME6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1b4Q99ME6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms