Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Nus1Q99LJ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nus1Q99LJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms