Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcbtb2Q99LJ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms