Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cstf3Q99LI7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cstf3Q99LI7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms