Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Abcf2Q99LE6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Abcf2Q99LE6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms