Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DhddsQ99KU1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DhddsQ99KU1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms