Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PpifQ99KR7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PpifQ99KR7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms