Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf19Q99KP6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf19Q99KP6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms