Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dctn2Q99KJ8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dctn2Q99KJ8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms