Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hps4Q99KG7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hps4Q99KG7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hps4Q99KG7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms